昌吉市屬于昌吉回族自治州，昌吉自治州屬于新疆維吾爾自治區(qū)。

昌吉市是新疆維吾爾自治區(qū)昌吉回族自治州下轄的一個(gè)縣級(jí)市，也是昌吉自治州州府所在地。昌吉州三面環(huán)抱新疆首府烏魯木齊市，昌吉州的州府昌吉市距距離魯木齊市中心35公里，距離烏魯木齊機(jī)場(chǎng)18公里。

昌吉回族自治州1954年成立，全州下轄5縣2市，2市分別是昌吉市、阜康市；5縣分別是瑪納斯縣、吉木薩爾縣、呼圖壁縣、奇臺(tái)縣、木壘哈薩克自治縣，還有3個(gè)國(guó)家級(jí)園區(qū)，分別是新疆準(zhǔn)東經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)、昌吉國(guó)家農(nóng)業(yè)科技園區(qū)、昌吉高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)。